開いたウインドウ側で、元のウインドウ内の変数に オブジェクトをセットする事によって操作可能です

http://lightbox.matrix.jp/ginpro/html/win_control_01.htm


[[開いたウインドウを閉じる]]
@HTML
<script type="text/javascript">

function closeWindow() {
	try {
		if ( openObject.closed ) {
			alert("ウインドウはウインドウ側で閉じられました");
		}
		else {
			openObject.close();
		}
		openObject = null;
	}
	catch(e) {
		alert("ウインドウが存在しません");
	}
}

</script>
<input type=button value="アンカーで開いたウインドウを閉じる" onclick='closeWindow();'>
@HEND

@DIV
<script type="text/javascript">

function closeWindow() {
	try {
		if ( openObject.closed ) {
			alert("ウインドウはウインドウ側で閉じられました");
		}
		else {
			openObject.close();
		}
		openObject = null;
	}
	catch(e) {
		alert("ウインドウが存在しません");
	}
}

</script>
<input type=button value="閉じる" onclick="closeWindow();">
@END